土荆芥具有祛风除湿、杀虫止痒、活血消肿等功效，主要用于治疗风湿痹痛、湿疹瘙痒、跌打损伤等病症。土荆芥的效果主要有缓解关节疼痛、改善皮肤瘙痒、促进外伤恢复、驱除肠道寄生虫、抑制细菌生长等。
土荆芥含有挥发油和黄酮类成分，能减轻风湿性关节炎引起的关节肿胀和僵硬。其煎煮液外敷可促进局部血液循环，缓解寒湿型腰腿疼痛。使用时应避免接触眼睛及破损皮肤，孕妇禁用。
土荆芥对湿疹、荨麻疹等皮肤疾病引发的瘙痒有缓解作用。其乙醇提取物可抑制组胺释放，减轻蚊虫叮咬或接触性皮炎导致的红肿痒痛。新鲜植株捣碎外敷需配合医用纱布，防止过敏反应。
土荆芥的活血成分有助于跌打损伤后淤血消散。民间常用其与红花、桃仁配伍制成药膏，加速软组织挫伤恢复。开放性伤口需消毒后再使用，避免继发感染。
土荆芥挥发油对蛔虫、钩虫等肠道寄生虫有麻痹作用，传统用法是与槟榔、南瓜子同煎空腹服用。儿童用药需严格把控剂量，寄生虫病严重时建议联合阿苯达唑片等驱虫药使用。
实验显示土荆芥水煎剂对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等常见致病菌有抑制作用。可辅助治疗轻度皮肤感染，但对深部组织感染或发热症状仍需及时就医。
使用土荆芥时建议咨询中医师辨证施治，避免过量引发恶心呕吐等不良反应。风湿病患者可配合艾灸调理，皮肤瘙痒者需保持患处清洁干燥。该药材不宜长期连续使用，症状缓解后应停药观察。储存时需放置阴凉通风处，防止霉变降低药效。
