研究发现KDM4是治疗儿童横纹肌肉瘤潜在靶点

儿童横纹肌肉瘤(Rhabdomyosarcoma，RMS)是一种在肌肉组织中形成恶性(癌)细胞的疾病，通常起始于连接骨骼并帮助躯体运动的肌肉中，由本应发展成骨骼肌的细胞所长成的癌症，是发病率最高的儿童软组织肉瘤。

研究者们还不知道大部分RMS病例的成因，但有可能是DNA中染色体异位造成。当少量DNA从细胞里的一条染色体转移到另一条染色体的时候，细胞里的某些基因可以被开启。这种改变被称为染色体易位，常在一个细胞分裂成两个新细胞的时候产生。这可能是造成大部分肺泡横纹肌肉瘤(Alveolar rhabdomyosarcoma, aRMS，横纹肌肉瘤主要类型之一)病例里癌变的原因。在这些癌症中，2号染色体(或者1号染色体)上的一小片转移到了13号染色体上，这导致一个叫PAX3(或PAX7)的基因转移到紧靠另一个叫FOXO1的基因旁边。胚胎肌肉组织开始形成时，PAX基因在细胞生长中起到重要作用，而一旦不需要的时候它们通常就会被关闭;FOXO1基因的正常作用是激活其他的基因。所以当这两个基因移在一起，就可能会激活PAX基因，导致肿瘤形成。核心转录调节回路(Core regulatory circuit，CRC)是一组相互连接的自动调节转录因子，它们形成环并可被超级增强子(superenhancer，SE) 识别。PAX-FOXO1融合蛋白就控制着这样一个CRC，并通过表观遗传重编程SE促进肿瘤生长。其中KDM4B(组蛋白赖氨酸去甲基化酶4B)对这类融合阳性的肿瘤的生长不可或缺。

2022年7月，美国圣裘德儿童医院杨俊教授 团队于Science Translational Medicine发表题为Targeting KDM4 for treating PAX3-FOXO1–driven alveolar rhabdomyosarcoma的研究论文，该研究发现，抑制 KDM4B可促进肿瘤消退，表明KDM4B可能是PAX-FOXO1+ RMS这类恶性儿童肿瘤潜在的治疗靶点。

基因转录失调是肿瘤标志性特征之一，其引导癌细胞转向依赖异常的转录程序。尤其是一小组相互关联的转录因子可以形成CRC来建立和维持各类癌细胞的身份和特征。嵌合转录因子 (Chimeric transcription factor，CTF)在构建癌症转录因子网络中起重要作用。融合基因PAX-FOXO1就是一种嵌合转录因子，并且是已知的致癌驱动因子。尽管这些转录因子对癌细胞的存活至关重要，但对它们有选择性地靶向依然是一项有挑战性的工作。

部分aRMS的转化主要由PAX3-FOXO1 或其变体 PAX7-FOXO1 融合蛋白驱动。PAX3-FOXO1 阳性 aRMS 比阴性 RMS 更具侵袭性，转移率更高，预后更差。尽管目前的治疗方式稳步提高了低风险 RMS 患者的生存率，但对于高风险，特别是融合阳性 RMS 患者的结果仍然令人沮丧。在少数治愈的患者中，积极的化疗和放疗往往会导致长期的不良反应，包括继发性恶性肿瘤。因此，迫切需要更好地了解融合阳性 RMS 的生物学，以开发更有效的疗法。

以往研究发现组蛋白赖氨酸去甲基化酶(KDM) 在嵌合转录因子驱动的许多癌症中活性失调。例如，KDM1A 与EWS-FLI1 相互作用，介导尤文肉瘤中肿瘤抑制因子的转录抑制，并维持 MLL-AF9 白血病干细胞的致癌潜力。SS18-SSX 癌蛋白被 KDM2B 募集以驱动滑膜肉瘤。而 MLL-AF9 介导的白血病发生需要 KDM4 家族成员的参与。MLL-GAS7 和 MOZ-TIF2 通过 KDM4C 介导急性髓细胞白血病的表观遗传重编程和转化。总之，这些数据表明，致癌融合转录因子需要KDM来进行肿瘤转化。然而，KDM是否参与由CTF控制的转录因子网络的维护尚不清楚。作者在本研究中揭示双重 H3K9me3/me2 和 H3K36me3/me2 去甲基化酶 KDM4B 是 PAX3-FOXO1 驱动的 aRMS 中关键转录因子的可靶向调节因子。

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