患有急性细菌性前列腺炎、非淋菌性尿道炎的患者不建议进行艾灸治疗。另外如果存在严重基础疾病的患者也不宜采用此方法来辅助治疗疾病。
1.急性细菌性前列腺炎：由于炎症反应强烈，常有寒战、高热、乏力等全身症状，以及会阴部疼痛、肿胀、发红及剧痛等症状。此时不宜行艾灸治疗，以免加重局部水肿和充血的情况，不利于病情恢复。通常需要遵医嘱使用注射用头孢曲松钠、盐酸左氧氟沙星片等药物抗感染治疗。
2.非淋菌性尿道炎：主要由衣原体或支原体感染引起，可出现尿频、排尿困难、尿急、尿痛、尿道口脓性分泌物增多等症状。
而艾灸具有温经散寒的作用，并无杀菌作用，因此无法起到治疗效果。一般需在医生指导下服用阿奇霉素分散片、罗红霉素胶囊等抗生素类药物控制感染。
3.其他情况：对于部分患有高血压、心脏病、肝病、肾病等慢性疾病的患者，也应避免采取该疗法。因为艾灸过程中可能会产生大量烟雾，吸入后可能会影响呼吸系统功能，从而导致原有疾病发作或者加重不适。
如果是处于妊娠期或者是月经期间的患者也不能做艾灸，否则有可能会对胎儿造成影响，还有可能导致阴道出血等情况发生。若自身不确定能否进行艾灸，可以到医院中医科就诊，通过望诊、切诊明确诊断，在医生指导下选择合适的治疗方法。
