灵芝表面发霉后应首先考虑扔掉以保障健康，因为霉菌产生的毒素可能会对身体造成伤害。
灵芝是一种珍贵的中药材，具有多种潜在的健康益处。然而，灵芝表面发霉可能使其产生对健康有害的物质，如黄曲霉毒素，这是一种强烈的肝毒性及致癌物。黄曲霉毒素可在不适宜的储存条件下生长和繁殖，空气中的湿度过高或密封不良都可能导致灵芝发霉。
如果灵芝轻微霉变且不舍得丢弃，建议用干净的布轻轻擦拭去除表面可见的霉菌，然后将灵芝放在阳光充足的地方彻底晒干。请注意，即使表面的霉菌看似清理干净，内部仍可能隐藏看不见的霉菌孢子和毒素，这使得食用变得不安全。晒干后灵芝应放置在干燥、通风、避光的地方存放，最好使用密封性良好的玻璃容器存储，以避免再次受潮。
为了防止灵芝再次发霉，存放环境的湿度控制十分关键。建议将其置于湿度相对较低的环境中，家中可使用干燥剂或除湿器保持空气干燥。定期检查灵芝状态，及时处理任何异常。在食用任何存储过久的灵芝时，检测其气味和外观是否正常也是必要的步骤。即便如此，在怀疑灵芝质量的情况下，宁可不使用，健康始终比珍稀的中药材更重要。
