干燕窝应密封后冷藏保存，避免冷冻导致营养流失或质地变化。
干燕窝蛋白质结构稳定，冷藏温度0-4℃能有效抑制微生物滋生，同时避免冷冻造成的燕窝纤维断裂。储存时需用密封罐或真空袋隔绝湿气，防止发霉变质。
冷冻环境会使燕窝中的活性成分如唾液酸结晶析出，解冻后易化水。反复冻融还会破坏盏形完整性，建议仅短期冷冻保存未泡发的燕窝，且不超过1个月。
干燕窝含水量需低于15%，冷藏前可放置食品干燥剂。若发现燕窝表面潮湿，需先阴干再储存，潮湿环境易滋生黄曲霉菌，导致营养价值下降。
紫外线会加速燕窝蛋白质氧化，建议用不透明容器存放。冷藏时远离冰箱照明区，与气味浓烈的食物如洋葱、榴莲分开放置，避免串味影响口感。
大盏燕窝可掰成小块分装，减少频繁开合造成的温湿度波动。每次取用后需立即密封，长期保存建议每月检查一次，发现霉斑需整批丢弃。
日常食用干燕窝可搭配冰糖炖煮或木瓜牛奶增强滋补效果，避免与辛辣食物同食。泡发时使用纯净水，夏季需冷藏泡发以防变质。储存超过半年的燕窝，建议缩短炖煮时间至20分钟以保留营养。体质虚寒者每周食用不超过3次，配合适量红枣调节温性。
