瓜子储存选择冷冻或冷藏需根据食用周期决定，短期冷藏防潮、长期冷冻保鲜。
冷藏环境湿度较高，未密封的瓜子易吸收水分导致软化变质。建议使用密封罐或真空袋包装，冷藏保存不超过1个月。冷冻层湿度更低，可阻断水分渗透，适合保存3个月以上。
瓜子含不饱和脂肪酸，冷藏温度仅能减缓氧化速度。冷冻环境下油脂氧化反应显著降低，-18℃可保持风味6-8个月。带壳瓜子比去壳瓜子更耐储存。
冷藏保存的瓜子能维持酥脆口感1-2周，冷冻后需回温至室温食用避免冷凝水影响。炒制瓜子比生瓜子更适宜冷冻，复热后风味损失较小。
冷藏无法杀灭瓜子中可能存在的虫卵，冷冻48小时可有效灭活虫卵。南方潮湿地区建议直接冷冻储存，防止仓储害虫二次滋生。
维生素E等营养素在冷冻条件下更稳定，冷藏超过2个月营养流失率达30%。短期食用量建议分装冷藏，长期储备选择冷冻更佳。
日常取用冷冻瓜子前可置于阴凉处缓化解冻，避免反复冻融。搭配干燥剂储存能提升防潮效果，核桃、碧根果等坚果类同样适用此法。湿热体质者每日食用量建议控制在30克以内，可搭配菊花茶降火。储存期间定期检查有无哈喇味，出现油蒿味需立即丢弃。
