决明子比荞麦壳更容易发霉，主要与成分特性、储存条件、加工方式、吸湿性及微生物环境有关。
决明子含油脂和糖类物质较高，为霉菌生长提供营养基础；荠麦壳以纤维素为主，缺乏霉菌繁殖所需养分。中药储存需注意决明子需密封冷藏，荠麦壳干燥通风即可。
决明子吸湿性强，含水量超过10%即易霉变；荠麦壳结构疏松利于水分蒸发。传统晒干法处理荠麦壳时，需反复翻晒至含水量低于8%。
带壳决明子表面沟壑易藏匿霉菌孢子，破壳后更易氧化变质；荠麦壳经高温脱壳处理可降低霉变风险。建议选购经辐照灭菌的决明子原料。
温度25℃以上时决明子霉变速度是荠麦壳的3倍，相对湿度75%环境下决明子3天即出现霉斑。可使用生石灰或硅胶干燥剂协同保存。
决明子宜用微波低温杀菌后真空包装，荠麦壳可蒸汽熏蒸后阴干。家庭保存可将决明子与花椒按10：1比例混装，荠麦壳定期日晒。
日常防霉需控制环境湿度在60%以下，决明子建议冷藏保存且不超过6个月，荠麦壳储存期可达2年。搭配薏苡仁、茯苓等利湿药材可降低霉变概率，使用前需观察有无结块、变色现象。梅雨季节可每周翻晒1次，发现霉变立即丢弃不可暴晒后继续使用。
