艾柱烟熏具有温经散寒、祛湿止痒、抗菌消炎等功效，主要用于风寒湿痹、皮肤瘙痒、杀菌消毒等情况。艾柱烟熏的操作方法主要有局部熏蒸、房间熏蒸、穴位熏蒸等。
艾柱烟熏产生的温热作用能促进血液循环，驱散体内寒邪，改善风寒湿邪导致的关节冷痛、肌肉僵硬等症状。艾叶挥发油中的艾叶酚等成分可刺激皮肤毛细血管扩张，增强局部代谢。使用时建议对准疼痛部位熏蒸15-30分钟，熏后注意保暖。
艾烟中的挥发油成分对湿疹、荨麻疹等皮肤问题有缓解作用，能减轻皮肤瘙痒、红肿。熏蒸时艾叶酮等物质通过皮肤吸收，抑制组胺释放。熏蒸部位需距离皮肤20-30厘米，避免烫伤，过敏性体质者慎用。
艾柱燃烧释放的艾叶油、桉叶素等成分对金黄色葡萄球菌、白色念珠菌等常见致病菌有抑制作用，可用于室内空气消毒。熏蒸时关闭门窗，每10平方米使用1-2根艾柱，熏后通风30分钟。但不建议替代正规医疗消毒措施。
艾烟的特殊气味能驱赶蚊虫，夏季可用于庭院或室内驱蚊。艾叶中的樟脑、侧柏酮等成分对库蚊、家蝇有驱避效果。使用时注意远离易燃物品，孕妇及哮喘患者应避免长时间接触浓烟。
艾叶芳香成分通过嗅觉刺激影响中枢神经系统，有助于缓解焦虑情绪。传统医学认为艾烟可疏通肝气，改善情志不畅。建议选择添加薄荷或陈皮的精制艾柱，每周熏蒸1-2次，每次不超过20分钟。
使用艾柱烟熏时需保持环境通风，避免烟雾浓度过高引发呼吸道不适。阴虚火旺体质、孕妇、婴幼儿及严重呼吸系统疾病患者慎用。皮肤熏蒸后可能出现轻微发红，属正常现象，若出现水疱或剧烈瘙痒应立即停用。日常可将艾柱与其他草药如苍术、白芷配伍使用增强效果，但过敏体质者需先小范围测试。存放时注意防潮，潮湿艾柱易产生有害烟雾。
