巴戟肉具有补肾壮阳、强筋健骨、祛风除湿等功效，常用于治疗肾虚阳痿、筋骨痿软、风湿痹痛等症状。
巴戟肉归肾经，能够温补肾阳，改善肾阳虚引起的畏寒肢冷、腰膝酸软、阳痿早泄等症状。肾阳虚患者可能出现性功能减退、夜尿频繁等表现，巴戟肉可配伍淫羊藿、肉苁蓉等药材增强疗效。现代研究表明其提取物具有类性激素作用。
巴戟肉能补肝肾、益精血，适用于肝肾不足导致的筋骨无力、骨质疏松。中老年人群关节疼痛、活动受限时，常与杜仲、续断等配伍使用。其活性成分可促进成骨细胞增殖，有助于预防骨骼退行性病变。
巴戟肉具有辛散温通特性，可缓解风寒湿邪侵袭引起的关节肿痛、屈伸不利。风湿性关节炎患者出现晨僵、游走性疼痛时，可与独活、桑寄生等同用。其抗炎作用能抑制前列腺素等致痛因子的释放。
巴戟肉多糖成分能增强巨噬细胞吞噬能力，提高机体免疫机能。体质虚弱易感冒者，长期适量服用可改善免疫功能。研究显示其提取物对T淋巴细胞增殖有促进作用，但需避免过量使用导致免疫亢进。
巴戟肉含有的甲基异茜草素等抗氧化成分，能清除自由基，减轻氧化应激损伤。更年期女性出现潮热盗汗时，可与女贞子、枸杞子配伍调理。动物实验表明其可延长衰老模型生物的生存期。
使用巴戟肉时应避免与寒凉药物同用，阴虚火旺者慎用。建议在中医师指导下辨证使用，常规煎服剂量为6-15克，可配伍肉类炖汤或浸酒服用。服药期间忌食生冷油腻，保持适度运动以增强药效吸收。若出现口干咽痛等不良反应应及时停用并咨询医师。
