艾蒿和艾草是同属菊科蒿属的两种不同植物，主要区别在于叶片形态、气味强度和药用部位。艾蒿叶片较宽呈羽状深裂，气味清淡，多作食用；艾草叶片细裂如丝，香气浓烈，以药用为主。鉴别要点包括观察叶形、揉搓闻味、对比花序，二者虽功效相近均能温经止血、散寒除湿，但艾草在中医灸疗中应用更广泛。
艾蒿叶片宽大呈卵形，边缘羽状深裂，裂片较宽且间距大，叶面灰绿色带绒毛；艾草叶片细长呈狭卵形，裂片如丝状或羽毛状，裂刻更深且密集，叶背密布白色蛛丝状绒毛。新鲜叶片揉搓后，艾蒿汁液呈淡绿色，艾草则渗出深绿偏褐的汁液。
艾蒿气味清冽略带青草香，挥发油含量较低；艾草具有强烈樟脑样香气，含桉油精、侧柏酮等挥发性成分更高。干燥后艾草香气持久度是艾蒿的3-5倍，制作艾绒时以手搓能粘附皮肤者为优质艾草。
艾蒿全草可入药但以嫩叶入膳为主，如清明粿、艾米果等；艾草传统取陈年老叶制艾绒，本草纲目特别强调"蕲州艾叶厚而茸多"的药用价值。现代研究显示艾草的黄酮类物质含量比艾蒿高47%左右。
二者花期均在7-10月，艾蒿头状花序较大，直径约3-5毫米，排列成较疏松的圆锥花序；艾草花序较小仅2-3毫米，组成密集的穗状圆锥花序。秋季结果期可见艾蒿瘦果具冠毛，艾草瘦果无毛或仅具退化冠毛。
艾蒿侧重食疗养生，可制作艾叶茶、艾蒿酒调理虚寒体质；艾草以治疗用途为主，艾灸时产生的近红外线穿透力更强。注意阴虚血热者慎用二者，艾草每日内服用量不宜超过9克，孕妇禁用艾灸。
日常使用建议优先选择叶片背面白绒密布、香气浓郁的艾草制作艾条，储存时需防潮避光。春季采集嫩叶可制作艾草青团，端午悬挂的驱蚊艾束以二者混合为佳。进行艾灸疗法时，应选用贮存三年以上的蕲艾制成的精纯艾绒，燃烧温度稳定且不易掉灰。搭配生姜片隔灸可增强散寒效果，但面部、大血管处及皮肤破损部位禁用直接灸。食用艾蒿制品后出现口干咽痛等上火症状时，可用金银花3克、菊花5克泡水缓解。
