火参果的籽一般不需要咬碎，可以直接吞咽。火参果籽含有膳食纤维和微量元素，但外壳较硬，咀嚼可能影响口感。消化功能较弱的人群可选择将籽打碎后食用。
火参果籽的外壳由木质素构成，人体难以完全分解，但肠道蠕动可帮助其自然排出。完整吞咽的籽能促进胃肠蠕动，有助于缓解便秘问题。籽中富含不饱和脂肪酸和植物甾醇，对心血管健康有一定益处。部分人群吞咽较大颗粒可能产生轻微不适感，这种情况可将果实连籽一起打成果汁饮用。
火参果籽含有少量葫芦素类物质，过量咀嚼可能释放微量苦味成分。胃肠敏感者直接吞咽大量硬质果籽可能引发腹胀，建议初次食用者控制单次摄入量。传统食用方法通常保留完整果籽，若追求营养吸收效率，可用破壁机将整果搅打成细腻浆汁。新疆等产区民间有将晒干果籽研磨入药的做法，但日常鲜食无须刻意咬碎。
食用火参果建议选择成熟度高的果实，果肉呈凝胶状时籽粒较软。可搭配酸奶或蜂蜜调节口感，每日食用量控制在1-2个为宜。保存时避免冷藏温度过低导致果籽硬化，脾胃虚寒者食用后可饮用姜茶暖胃。若出现胃肠不适，应立即停止食用并咨询医师。
